A Promotoria de Justiça de Bacia Hidrográfica do Médio Araguaia recebe esta denominação por compreender os Rios Areões, São João Grande, Cristalino e das Mortes, todos tributários do Rio Araguaia, porém, também compreenderá em parte, o extremo Sudeste da Bacia do Xingu, aportando parte da margem direita do Rio Culuene e seus afluentes, que junto ao Rio Suiá-miçu, são tributários do Rio Xingu. Nesses corpos hídricos se encontram a UHE Mortes 2 em instalação, 2 PCHs em operação, 2 UTEs em operação e 1 UTE desativada.
A Promotoria de Justiça de Bacia Hidrográfica do Médio Araguaia abarcará as comarcas de Água Boa, Campinápolis, Canarana, Nova Xavantina, Querência e Ribeirão Cascalheira, devendo a sede ser instalada em Nova Xavantina.
Assim, a Promotoria de Justiça abrangerá 66.549 km² sob sua circunscrição, dentre eles 6.243 km² são áreas requeridas e/ou em licenciamento junto ao Departamento Nacional de Pesquisa Mineral (DNPM). Ademais, apenas no ano de 2014 foram desmatados 15 km² de floresta nessa região.
Trata-se de um ecótono (zona de contato) entre os biomas Cerrado e Amazônico. Nesta região, está inserida parte da chamada planície do Bananal, área úmida que apresenta um dinâmico sistema rio-planície de inundação, que abriga grande diversidade de organismos adaptados a esta condição. Essas importantes áreas úmidas vêm sendo drenadas ilegal e irregularmente para a utilização do solo.
Cuida-se, também, de região de expansão agrícola, em que extensas áreas de pastagem vêm sendo substituídas por lavouras de soja, milho e algodão. Como consequência, nos últimos anos registrou-se grande quantidade de queimadas na localidade, inclusive nos períodos proibitivos. A título de exemplo, no ano de 2014, foram detectados 616 focos de calor.
Comarcas: Água Boa, Campinápolis, Canarana, Nova Xavantina, Querência e Ribeirão Cascalheira.